mRNA網羅的発現解析のご相談例です。
＜実験計画＞
サンプル：動物（マウスまたはラットの予定）
処理群：3群
評価組織：4～6項目（各群n=1の予定）
すなわち3群×（4〜6）項目＝12〜18サンプル
送付検体：total RNA
希望解析内容：シークエンシング、データ解析（マッピング、発現量比較、アノテーション）
回答です
解析ですが、
Hiseq2000 1lnaeで6～9サンプルを混合してランするのをお薦め致します。
価格は、
50,000(library製作費）xサンプル数
+ 750,000（2lane価格）
+サンプル数 x65,000(データ解析費）円
＝213万円〜282万円（税別）（12〜18サンプルとした場合）です。
もしraw dataだけの場合はデータ解析費用の発生は御座いません。