例えば、ソウル大から発表された2011年の論文があります。この論文では、線維芽細胞とiPS細胞、ES細胞の比較を、mRNAマイクロアレイとタンパク質(iTRAQによる網羅的定量解析)によって行っています。結果的にES細胞とiPS細胞でもタンパク質発現が異なっており、タンパク質合成や代謝に関わるタンパク質で違いが見られたようです。
幹細胞での実施例
iPSではありませんが、幹細胞について解析した例は多く挙がっています。例えばmESCとmEpiSCの比較、授精と核移植の比較を同時に行ったO’Brienらの論文などもあります。
iPS細胞とiTRAQに関する参考文献
ほかにもこんな論文があります
- Fröhlich, Thomas, Miwako Kösters, Alexander Graf, Eckhard Wolf, Julianna Kobolak, Vincent Brochard, András Dinnyés, Alice Jouneau, and Georg J. Arnold. “iTRAQ Proteome Analysis Reflects a Progressed Differentiation State of Epiblast Derived versus Inner Cell Mass Derived Murine Embryonic Stem Cells.” Journal of Proteomics 90 (September 2, 2013): 38–51. doi:10.1016/j.jprot.2013.03.015.
- O’Brien, Robert N., Zhouxin Shen, Kiyoshi Tachikawa, Pei Angel Lee, and Steven P. Briggs. “Quantitative Proteome Analysis of Pluripotent Cells by iTRAQ Mass Tagging Reveals Post-Transcriptional Regulation of Proteins Required for ES Cell Self-Renewal.” Molecular & Cellular Proteomics: MCP 9, no. 10 (October 2010): 2238–51. doi:10.1074/mcp.M110.000281.
- Wang, Yun-Feng, Jian Li, Ying-Zi He, Hui-Qian Yu, Yang Li, Xiao-Dong Gu, Wen Li, and Hua-wei Li. “iPSCs Are Transcriptionally and Post-Transcriptionally Indistinguishable from fESCs.” Frontiers in Bioscience (Landmark Edition) 17 (2012): 1659–68.