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ストレス環境下でのゲノム変異を調べたい[次世代シーケンス受託ご相談例]

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ゲノム変異を調べたい、というご相談例です

我々は、ストレス環境下で培養した、10株程度の**菌(ゲノムサイズ:6 Mb)の変異箇所を同定したいと考えております。この場合、Hi-seqの100bpペアエンドで、10種のタグを用いて行うのがベストと考えておりますが、どうでしょうか?そこで、もしも、御社にお願いしたばあい、10株のライブラリー調製も合わせてお願いして、料金と納期はどの程度になるでしょうか?

 

回答です

・緑膿菌10種のゲノム解析を実施する場合の、解析プランと納期と費用
>Hiseq2000,100bp paired-end、2Gb/sample、library製作込、Fastqファイル 納品で720,000円(税別)です。

納期はサンプルQC pass後6~8週です。

・解析結果でマッピングとSNPs解析を実施した時の納期と費用
>価格は1,132,500円(税別)です。納期は7~9週です。