ご相談例です

de novo次世代シーケンスを考えております。サンプルはあるコケですが、ゲノムサイズはわかりません。別種ゴケと同じ程度の500Mbだとした場合の、シーケンス、アッセンブリ、ゲノム解析にかかる大まかな費用を教えてください。

 

回答です

draft　de novo解析の場合、
ゲノムsizeを考慮すればHiseq, 100PE, 2lane程度がいいかと思います。
データ解析はassemblyまでで867,500円（税別）で提供可能です。
研究目的によってはdraftではない可能性もあると思います。
その場合はmatepair実験またはPacbioデータも必要になる可能性もあります。
詳細な実験目的を教えて頂ければdesign可能です。