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デブロッキング処理からのN末端アミノ酸配列分析

ほ乳類細胞では、N末端がブロックされたタンパク質の80%以上がアセチル化されたタンパク質であるといわれ、そうしたタンパク質は、エドマン分解によるN末端アミノ酸配列分析を行うことができません。しかしながらN末端がアセチルセリン、アセチルトレオニンの場合は、TFA によってデブロックすることができます。 また、N末端グルタミン酸およびグルタミンは環化され、ピログルタミン酸となることがあります。この変換反応は in vivo のみならず in vitro でも起こり、エドマン分解によるN末端アミノ酸配列分析を行うことができません。その場合、N末端配列分析を行うためには、ピログルタミル基の除去が必要となります。 上記のような状態の際に、デブロッキングを行った後にN末端アミノ酸配列分析を行います。まずは、ご相談の上進め方を決定いたします。